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      用第一性原理超越AlphaFold:告別蛋白質(zhì)工程的「碰運(yùn)氣」時(shí)代

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      真正的突破在于讓模型學(xué)會(huì)"舉一反三",在3-4個(gè)突變位點(diǎn)的平衡木上演繹生命的無限可能。

      作者丨岑峰

      2026年1月9日,“第四屆合成生物學(xué)及生物制造大會(huì)”在深圳光明隆重召開。在“AI生物制造專場”上,華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院院長助理?xiàng)顣凿h副教授做了題為《AI時(shí)代下的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)與制造》的主旨演講。

      蛋白質(zhì)作為生命的物質(zhì)基礎(chǔ),其工程化改造不僅支撐著生物醫(yī)藥、化妝品等千億級(jí)產(chǎn)業(yè),更是生物制造的核心競爭點(diǎn)。在楊曉鋒教授看來,AI for Science(AI4S)的興起,正在從根本上重塑蛋白質(zhì)從“序列設(shè)計(jì)”到“工業(yè)智造”的全生命周期。

      楊曉鋒在報(bào)告中深刻闡述了蛋白質(zhì)工程的“第一性原理”:序列決定結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)決定功能。在AI時(shí)代,這一經(jīng)典理論被賦予了全新的數(shù)字化內(nèi)涵。AI4S的本質(zhì),是將生物物理法則與海量數(shù)據(jù)結(jié)合,構(gòu)建可計(jì)算的統(tǒng)計(jì)模型。然而,楊曉鋒敏銳地指出,蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)并非類似于人臉識(shí)別技術(shù)的簡單遷移。相較于圖像識(shí)別中維度的相近,AI4S的技術(shù)困境在于生物大分子的有限采樣數(shù)據(jù)與近乎無限的序列空間之間存在著巨大的維度鴻溝。這種“維度不匹配”和對(duì)生物功能“高度精確”的要求,使得蛋白質(zhì)AI設(shè)計(jì)成為了AI4S領(lǐng)域最具挑戰(zhàn)性的高峰。

      報(bào)告的核心看點(diǎn)在于對(duì)“外推能力(Extrapolation)”的深入探討。楊曉鋒認(rèn)為,真正的AI4S不應(yīng)僅停留于對(duì)已知數(shù)據(jù)分布的“內(nèi)推”預(yù)測,而必須具備跨越稀疏分布、探索認(rèn)知盲區(qū)的能力。通過借鑒大語言模型的邏輯,利用數(shù)十億條天然序列進(jìn)行無監(jiān)督預(yù)訓(xùn)練,模型得以掌握生命的“語法”,結(jié)合少量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的有監(jiān)督學(xué)習(xí),從而實(shí)現(xiàn)在從未見過的復(fù)雜突變組合中精準(zhǔn)推演。這種從“內(nèi)向歸納”向“外向演繹”的范式轉(zhuǎn)變,正是AI驅(qū)動(dòng)科研發(fā)現(xiàn)的核心價(jià)值所在。

      除了算法層面的攻堅(jiān),楊曉鋒還展示了AI4S如何向下延伸至“制造”端。他提出了一種極具工程智慧的方案:可切割自聚集標(biāo)簽法。這種設(shè)計(jì)能夠讓目標(biāo)蛋白在表達(dá)后自聚集沉淀,與其他蛋白有效分離,從而繞過高昂的工業(yè)純化工藝。更重要的是,這種簡化的制造流程為AI研發(fā)提供了極高通量的實(shí)驗(yàn)反饋,構(gòu)建起了“設(shè)計(jì)-制造-測試”的高速閉環(huán)。這種數(shù)據(jù)與實(shí)驗(yàn)的量級(jí)加速,生動(dòng)詮釋了AI4S如何打破傳統(tǒng)研發(fā)的效率天花板。

      楊曉鋒總結(jié)道,蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)正從“偶然發(fā)現(xiàn)”跨越到“必然創(chuàng)造”。無論是解析深海未知蛋白,還是定向進(jìn)化高性能酶,AI4S都將作為底層引擎,推動(dòng)生物制造走向更加精準(zhǔn)、高效的未來。

      以下為楊曉鋒在“第四屆合成生物學(xué)及生物制造大會(huì)”上的演講實(shí)錄,限于篇幅,AI科技評(píng)論進(jìn)行了不修改原意的編輯:


      人工智能時(shí)代下蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì)與制造

      演講人:華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院院長助理?xiàng)顣苑?/strong>

      非常感謝大會(huì)的邀請(qǐng),讓我有機(jī)會(huì)在這里與大家分享關(guān)于蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)與制造的一些思考。剛剛,張總、李總已經(jīng)對(duì)蛋白質(zhì)、酶的特性以及人工智能(AI)在其中的應(yīng)用做了非常精彩的報(bào)告,這為我接下來詳細(xì)探討人工智能時(shí)代下蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì)與制造奠定了良好的基礎(chǔ)。

      當(dāng)我們談?wù)摰鞍踪|(zhì)時(shí),從廣義上講,它可以涵蓋多肽、酶、抗體等。蛋白質(zhì)領(lǐng)域有一個(gè)非常顯著的特點(diǎn),那就是其巨大的商業(yè)價(jià)值和產(chǎn)業(yè)帶動(dòng)能力。序列與功能之間存在著極其緊密的關(guān)聯(lián),往往一個(gè)獨(dú)特的多肽序列、一種高效的酶或是一個(gè)精準(zhǔn)的抗體,就足以支撐起一個(gè)百億美金甚至千億美金規(guī)模的巨大產(chǎn)業(yè)。在該領(lǐng)域中,氨基酸序列排列組合產(chǎn)生的可能性是無窮無盡的,可衍生出了無數(shù)不同細(xì)分的專業(yè)領(lǐng)域,這正是蛋白質(zhì)領(lǐng)域最吸引人、也最具挑戰(zhàn)性的魅力所在。

      目前,我國在蛋白質(zhì)及其相關(guān)產(chǎn)業(yè)方面投入了巨大力量,特別是在廣東地區(qū)。廣東省作為國內(nèi)化妝品、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的大省。這些產(chǎn)品中,很大一部分涉及到多肽和蛋白活性成分,因此如何更好地完成蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì)與生產(chǎn),對(duì)于支撐地區(qū)經(jīng)濟(jì)和相關(guān)產(chǎn)業(yè)鏈具有舉足輕重的作用。今天,我的分享主要圍繞兩點(diǎn):第一是“創(chuàng)造”,即如何設(shè)計(jì)出高性能的蛋白質(zhì);第二是“制造”,即如何通過生物制造的手段將設(shè)計(jì)出的高性能蛋白質(zhì)生產(chǎn)出來。

      在深入技術(shù)細(xì)節(jié)之前,我想先探討一下這背后的底層邏輯。我們都知道,埃隆·馬斯克曾多次強(qiáng)調(diào)“第一性原理”(First Principles),這種思維方式顛覆了許多傳統(tǒng)觀念。例如,在航天領(lǐng)域,傳統(tǒng)認(rèn)知認(rèn)為火箭必須使用極致輕量化、高強(qiáng)度但非常昂貴的復(fù)合材料,但馬斯克回歸到材料成本與物理性能的最根本邏輯,提出了使用不銹鋼制造火箭的可能性,并創(chuàng)建了SpaceX實(shí)現(xiàn)了出來。蛋白質(zhì)科學(xué)同樣遵循其獨(dú)特的第一性原理,這便是由Anfinsen提出的著名理論:蛋白質(zhì)的氨基酸序列決定了其三維結(jié)構(gòu),而結(jié)構(gòu)進(jìn)一步?jīng)Q定了其生物學(xué)功能。這個(gè)邏輯鏈條意味著,只要我們掌握了一個(gè)明確的序列,它在生理?xiàng)l件下理論上對(duì)應(yīng)著唯一確定的結(jié)構(gòu),即可知其具體的生物學(xué)功能。但如果要用傳統(tǒng)的計(jì)算方法去窮舉和模擬這個(gè)過程,其計(jì)算量巨大到幾乎無法實(shí)現(xiàn),但這種序列與結(jié)構(gòu)之間確定的對(duì)應(yīng)關(guān)系,為AI算法的介入提供了可能。

      在當(dāng)前的AI時(shí)代,蛋白質(zhì)的研究可以分為兩個(gè)維度:正向的“預(yù)測”與反向的“設(shè)計(jì)”。預(yù)測是指從已知的序列出發(fā),推測其結(jié)構(gòu)與功能;而設(shè)計(jì)則是根據(jù)我們預(yù)設(shè)的功能或目標(biāo)結(jié)構(gòu),去反向?qū)ふ夷軌驅(qū)崿F(xiàn)該目標(biāo)的氨基酸序列。在人工智能大規(guī)模應(yīng)用之前,科學(xué)家們主要通過理性設(shè)計(jì)、從頭設(shè)計(jì)以及定向進(jìn)化等傳統(tǒng)方法來改良蛋白質(zhì)。然而,隨著深度學(xué)習(xí)技術(shù)的橫空出世,整個(gè)領(lǐng)域發(fā)生了范式遷移。

      AI在生物學(xué)中的應(yīng)用,很大程度上受益于計(jì)算機(jī)視覺和圖像識(shí)別領(lǐng)域的發(fā)展。圖像識(shí)別的邏輯在于通過海量數(shù)據(jù)訓(xùn)練模型,使模型學(xué)習(xí)到某種特征分布,進(jìn)而預(yù)測未知物。蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)同樣需要利用已知數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練,但它面臨著比圖像識(shí)別更為嚴(yán)峻的科學(xué)挑戰(zhàn)。

      這就是很多人問的:為什么人臉識(shí)別已經(jīng)可以做到如此精準(zhǔn)和高效,而蛋白質(zhì)的AI設(shè)計(jì)依然困難重重?其根本原因在于維度的不匹配。因?yàn)椋珹I的核心邏輯是無限地模擬和逼近已有數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分布,如果訓(xùn)練集的質(zhì)量越高、分布越廣,我們預(yù)測的可能性就越能聚焦于真實(shí)的功能區(qū)間。在圖像識(shí)別中,采集數(shù)據(jù)與預(yù)測目標(biāo)的數(shù)據(jù)分布相近,特征空間相對(duì)閉合。但在生物學(xué)領(lǐng)域,訓(xùn)練集的采樣量與我們需要預(yù)測的龐大序列空間之間存在著巨大的鴻溝。更重要的一點(diǎn)在于,在設(shè)計(jì)或生成的任務(wù)上,圖像生成允許一定程度的“模糊”或“似是而非”,只要看起來像即可;而生物學(xué)設(shè)計(jì)則要求有絕對(duì)的“功能性”。一個(gè)AI生成的圖片,即使細(xì)節(jié)有誤,人們或許仍能辨認(rèn)出其主體;但一個(gè)蛋白質(zhì)序列,哪怕只有一個(gè)關(guān)鍵位點(diǎn)的氨基酸發(fā)生錯(cuò)誤,其空間構(gòu)型就可能崩塌,導(dǎo)致功能完全喪失。

      事實(shí)上,我們可以看到,現(xiàn)有的生成式模型在處理復(fù)雜邏輯時(shí)仍會(huì)表現(xiàn)出局限性。例如,某些AI在生成動(dòng)物圖像時(shí),可能會(huì)給螞蟻畫出四只腳,因?yàn)樗鼘W(xué)習(xí)到的訓(xùn)練分布中大部分陸生動(dòng)物都是四只腳。這種錯(cuò)誤在圖像中或許只是笑談,但在蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)中則是致命的。

      以蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測為例, AlphaFold系列模型的橫空出世,利用深度學(xué)習(xí)模型實(shí)現(xiàn)了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的跨越式進(jìn)展。然而,我們必須清醒地意識(shí)到,這類模型本質(zhì)上仍是基于“見過”的數(shù)據(jù)進(jìn)行歸納。前不久,我與南海海洋研究所的同行溝通時(shí)發(fā)現(xiàn),AlphaFold對(duì)于很多海洋生物的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測往往會(huì)“失效”。總結(jié)來講,AI的強(qiáng)大之處在于它能極度精準(zhǔn)地推算訓(xùn)練分布范圍內(nèi)的可能性,但它對(duì)于分布之外的新奇生命形式,依然缺乏真正的創(chuàng)造力。這也正是我們?cè)诘鞍踪|(zhì)設(shè)計(jì)與制造過程中,需要不斷探索和突破的邊界。

      除了序列空間龐大的問題,在蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)過程中,我們必須高度關(guān)注所謂的“上位效應(yīng)”( epistasis)。這就像下圍棋一樣,每一步棋的選擇都不是孤立的:你下第一步可能是好棋,第二步看起來也不錯(cuò),但有可能到了第三步,整個(gè)布局可能就崩了,導(dǎo)致最終的失敗。在當(dāng)前的技術(shù)背景下,如果我們只是追求局部的步步優(yōu)化,往往會(huì)出現(xiàn)“連步皆好、全局皆輸”的窘局。這種現(xiàn)象反映在算法上,就是預(yù)測與設(shè)計(jì)的收斂速度問題。在傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)工程中,我們通常采用經(jīng)典的“爬坡法”進(jìn)行定向進(jìn)化,通過不斷的突變與篩選試圖達(dá)到功能的頂峰。然而,這種緩慢的爬坡過程極其容易讓研究陷入“局部最優(yōu)解”的陷阱。當(dāng)你認(rèn)為已經(jīng)找到了最好的序列時(shí),實(shí)際上你可能只是被困在了某個(gè)低矮的山頭,而真正的珠穆朗瑪峰可能就在不遠(yuǎn)處,但由于算法無法突破當(dāng)前的局部邏輯,你永遠(yuǎn)無法看到它。

      因此,當(dāng)我們利用AI去介入蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)時(shí),要從底層架構(gòu)上設(shè)法突破這種局部最優(yōu)的限制。在具體的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)案例中,目前主要存在兩種主流的技術(shù)范式。一種是理性的直接生成模式,比如劉海燕老師團(tuán)隊(duì)的工作,通過建立能量分布模型,連續(xù)、廣泛地搜索主鏈結(jié)構(gòu)空間,自動(dòng)產(chǎn)生“高可設(shè)計(jì)性”主鏈,從而生成蛋白。當(dāng)然,還有David Baker團(tuán)隊(duì)利用擴(kuò)散模型(RFDiffusion)等生成式AI技術(shù)。

      另一種是以定向進(jìn)化為基礎(chǔ)。針對(duì)剛才提到的“爬坡法”陷入局部最優(yōu)的問題,清華大學(xué)的張樹一老師團(tuán)隊(duì)提出了很有啟發(fā)性的思路。他們將蛋白質(zhì)長序列切割成若干個(gè)功能片段,并在每個(gè)片段上尋找最優(yōu)的構(gòu)象與序列組合。這種方法引入了的概念叫:蛋白質(zhì)序列-功能空間壓縮,進(jìn)行有效的空間壓縮與特征重組,避免了整體序列在優(yōu)化過程中過快地陷入局部最優(yōu)。

      歸根結(jié)底,AI在蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)領(lǐng)域的成敗,極大地取決于:

      (1)數(shù)據(jù)的質(zhì)量與多樣性。你輸入什么樣的數(shù)據(jù)去訓(xùn)練,決定了模型最終的視野。如果你只是盲目地將一批未經(jīng)清洗或缺乏標(biāo)注的數(shù)據(jù)灌入模型,往往無法得到理想的反饋。在AI發(fā)展史上,斯坦福大學(xué)的李飛飛教授建立的ImageNet數(shù)據(jù)集,直接推動(dòng)了人工智能、計(jì)算機(jī)視覺領(lǐng)域的突飛猛進(jìn)。ImageNet不僅提供了海量的圖像,更重要的是提供了高質(zhì)量的人工標(biāo)注。這充分證實(shí)了:拿到高質(zhì)量的、更全面的、具有明確功能標(biāo)注的生物數(shù)據(jù)是何等重要。

      (2)先進(jìn)而恰當(dāng)?shù)哪P汀D壳埃覀兒芏鄰氖律飳W(xué)研究的人員面臨著一個(gè)現(xiàn)實(shí)的困境,那就是計(jì)算資源缺乏。作為一個(gè)科研實(shí)驗(yàn)室,我們不可能擁有大廠或頂級(jí)科技公司那樣龐大的算力資源,進(jìn)行數(shù)千億參數(shù)規(guī)模的超大規(guī)模訓(xùn)練。在這種情況下,我們是應(yīng)該追求大模型,還是應(yīng)該追求“恰當(dāng)?shù)哪P汀保繌哪壳暗奈墨I(xiàn)中可以看到,很多成功的案例往往并沒采用超大模型,而是選用了參數(shù)規(guī)模適中、結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)精巧的模型,針對(duì)特定的科學(xué)任務(wù)進(jìn)行深度優(yōu)化。我們也許不需要為了設(shè)計(jì)一個(gè)蛋白去運(yùn)行一個(gè)上百億參數(shù)的通用模型,而是應(yīng)該在算力可控的范圍內(nèi),針對(duì)特定的理化特征和功能需求進(jìn)行精細(xì)化建模。

      (3)充分考慮外推能力的問題。蛋白質(zhì)序列的已知空間與其理論上存在的巨大空間相比,分布是極其稀疏的。我們必須思考如何通過創(chuàng)新的算法、框架與路徑跳出這種稀疏分布的限制,實(shí)現(xiàn)從“內(nèi)推”到“外推”的跨越,尋找那些處于人類認(rèn)知盲區(qū)但符合生物物理法則的高維功能區(qū)。

      我們實(shí)驗(yàn)室,也開展了AI應(yīng)用于蛋白質(zhì)預(yù)測與設(shè)計(jì)的研究。其中,在蛋白質(zhì)預(yù)測上,我們解決的是:如何從海量的宏基因組數(shù)據(jù)中精準(zhǔn)地挖掘出具有特定功能的序列。我們選定的目標(biāo)是從人體微生物組(Microbiome)數(shù)據(jù)中尋找具有特定抗菌活性的蛋白,lysin。由此,我們建立了一個(gè)融合了序列特征和理化特征的深度學(xué)習(xí)架構(gòu)DeepMineLys。這個(gè)模型的邏輯在于:首先,有一個(gè)覆蓋全面,高質(zhì)量的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,即是要盡量地?cái)U(kuò)大訓(xùn)練數(shù)據(jù)所能覆蓋的空間;(2)我們不僅從序列的“語言模式”角度進(jìn)行語義捕捉,還引入了蛋白質(zhì)的電荷分布、疏水性等物理化學(xué)維度。這種多維度的特征融合,極大地加強(qiáng)了模型對(duì)相似序列之間細(xì)微功能差別的識(shí)別能力。(3)我們采用相似度低于60%的模型沒見過的獨(dú)立測試集要評(píng)估,對(duì)判斷其外推能力。這個(gè)模型在我們實(shí)驗(yàn)室小型的服務(wù)器上就能高效運(yùn)行,測試結(jié)果非常令人振奮:我們挖掘出的一些高活性的溶菌酶,成功率在70%左右,有的甚至比標(biāo)準(zhǔn)的雞蛋清溶菌酶高出五六倍。目前,我們的研究已經(jīng)迭代到了第二代模型,其預(yù)測精度和功能覆蓋率達(dá)到了更高的水平。

      接下來,我想通過第二個(gè)案例來聊聊如何將AI應(yīng)用于蛋白質(zhì)的定向進(jìn)化。對(duì)于蛋白質(zhì)設(shè)計(jì),我們課題組目前主要沿著定向進(jìn)化的路線進(jìn)行思考,并開發(fā)了一套分層訓(xùn)練、迭代進(jìn)化的模型DeepDE。這個(gè)模型的邏輯是:首先在大規(guī)模通用數(shù)據(jù)集上訓(xùn)練獲得基礎(chǔ)模型,接著將其遷移到蛋白質(zhì)家族的性能訓(xùn)練上,最后再到目標(biāo)蛋白突變體的真實(shí)數(shù)據(jù)上。就像對(duì)于人臉,先是“全球人群”的訓(xùn)練,再到“中國人群”的訓(xùn)練,最后是針對(duì)具體的“深圳人群”。在實(shí)際操作中,我們利用大約一千個(gè)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)點(diǎn)作為最后的有監(jiān)督學(xué)習(xí),這在一般的實(shí)驗(yàn)室通量中是比較合理的規(guī)模。

      為了驗(yàn)證模型是否具備真正的“外推能力”(Extrapolation),我們?cè)谟?xùn)練設(shè)計(jì)上特意制造了信息差。具體而言,我們只給模型提供包含一個(gè)或兩個(gè)突變位點(diǎn)的數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練,而在測試環(huán)節(jié),則要求模型預(yù)測三突變的性能。這是一個(gè)極具挑戰(zhàn)性的任務(wù),因?yàn)槟P捅仨氃趶奈匆娺^三點(diǎn)突變組合的情況下,通過邏輯推演給出準(zhǔn)確預(yù)測。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,對(duì)于這些從未見過的復(fù)雜突變組合,我們的模型的預(yù)測相關(guān)性達(dá)到了0.7左右。在蛋白質(zhì)蕘中,能對(duì)這種分布外的數(shù)據(jù)達(dá)到0.7的相關(guān)性,已經(jīng)證明模型具備了超越簡單統(tǒng)計(jì)模擬的深度理解能力。通過這種迭代,我們僅用了四輪實(shí)驗(yàn),就拿到了性能遠(yuǎn)超目前所有綠色熒光蛋白亮度的突變體。

      這里需要強(qiáng)調(diào)的是,我們所追求的“外推能力”是AI驅(qū)動(dòng)蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)的核心競爭力。現(xiàn)在很多所謂的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)僅僅是“內(nèi)推”,即在已知的分布內(nèi)尋找最優(yōu)值,這往往只能得到一些性能略有提升但缺乏突破性的結(jié)果。而在探索這些尚未觸及的高維空間時(shí),將突變范圍控制在3到4個(gè)位點(diǎn)之間,可能是目前AI輔助定向進(jìn)化中一個(gè)比較平衡且高效的范圍。

      當(dāng)我們完成了蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì),下一個(gè)挑戰(zhàn)便是如何將其制造出來。眾所周知,蛋白質(zhì)的表達(dá)與純化是一個(gè)極具挑戰(zhàn)性的過程。無論采用大腸桿菌、酵母還是其他細(xì)胞體系,在實(shí)驗(yàn)室里通過層析柱進(jìn)行小量純化是可行的,但在工業(yè)化大規(guī)模生產(chǎn)中,層析柱的高昂成本和復(fù)雜工藝往往成為瓶頸。

      基于此,我們從“工程邏輯”角度出發(fā)提出了一種新思路。既然蛋白質(zhì)在某些情況下會(huì)自動(dòng)聚集形成有活性的包涵體,那么我們能否用于蛋白純化上?由此,我們開發(fā)了cSAT技術(shù),讓目標(biāo)蛋白在表達(dá)時(shí)自組裝成聚集體,沉淀出來。隨后,我們只需要通過簡單的離心,就能獲得高純度的蛋白沉淀,再通過一段可切割的標(biāo)簽將目標(biāo)蛋白釋放出來。這種方法避免了高成本而繁瑣的柱層析,極大簡化了工藝。

      這種制造方式的意義不僅在于降低成本,更在于其與AI研發(fā)的完美契合。我們可以將其放入自動(dòng)化的孔板中進(jìn)行高通量操作。這意味著AI生成的大量設(shè)計(jì)序列可以被快速、廉價(jià)地轉(zhuǎn)化為實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),從而反哺模型,加速蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)迭代。

      總結(jié)來說,我們提供的思路涵蓋了從新蛋白的挖掘到算法驅(qū)動(dòng)的定向進(jìn)化,再到工業(yè)化標(biāo)簽純化的完整方案。接下來,無論是產(chǎn)生高質(zhì)量的數(shù)據(jù),還是進(jìn)行高通量的驗(yàn)證,核心都在于通過AI與自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)的深度融合,回到“第一性原理”與“工程邏輯”。

      最后,感謝我們團(tuán)隊(duì)的努力和相關(guān)基金的支持!感謝本次大會(huì),感謝大家!

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