胎兒染色體大片段重復，原來是媽媽給的“誤會”

* 僅供醫學人士參考

無創產前基因檢測（NIPT）是近年來備受矚目的產前檢測技術，它的核心是對孕婦外周血中胎兒游離DNA（cff DNA）進行富集，并通過高通量測序技術，結合生信分析，來判斷胎兒是否存在21、18、13號等染色體非整倍體異常或拷貝數變異（copy number variations, CNVs）。

因其“無創”及對21-三體綜合征、18-三體綜合征、13-三體綜合征具有較高的靈敏度和特異性，無創產前基因檢測是許多孕婦進行產前篩查時的首選項目。當NIPT提示胎兒染色體非整倍體異常或CNVs時，需進一步行產前診斷。

案例經過

孕婦單胎自然妊娠16周+1天，自主選擇行NIPT檢測，NIPT結果提示：胎兒1號染色體p35.2-p34.1（30724916-44351816）區域存在約13.63Mb的重復。

孕婦隨后（孕18周）預約羊水穿刺進行羊水細胞染色體核型分析與低深度全基因組測序（CNV-seq）檢測。羊水穿刺十天后，CNV-seq結果提示：送檢樣本未發現染色體非整倍體變異及已知的、致病性明確的100Kb以上的微缺失/微重復變異！

究竟是標本錯誤？還是漏檢？或是結果假陽性？

案例分析

孕婦NIPT結果查見1p35.2-p34.1（30724916-44351816）區域存在長約13.63Mb的重復，DECIPHER數據庫查見該片段涉及290個基因，其中蛋白編碼基因超過50個，Clingen數據庫未查見該片段包含明確三倍劑量敏感基因（TS=3）。

孕婦NIPT檢測結果1號染色體原始圖譜

羊水CNV-seq結果：未發現染色體非整倍體變異及已知的、致病性明確的100Kb以上的微缺失/微重復變異。

羊水CNV-seq檢測結果1號染色體原始圖譜

13.63Mb的大片段重復，CNV-seq不應該存在漏檢的情況。

首先排除是否羊水標本混淆，查找后發現該批次CNV-seq檢測標本中未出現1號染色體大片段重復的結果，結合NIPT結果圖譜中1號染色體在p35.2-p34.1區域的Z-score值接近2，系統明確判定其為胎兒來源。

那是否是胎盤嵌合或母體因素導致的NIPT結果假陽性，甚至是NIPT標本混淆呢？此時羊水細胞染色體核型結果未出，為及時明確NIPT與CNV-seq結果不相符的原因，我們同時對孕婦16周+1天采集的無創標本、18周采集的羊水標本以及用于羊水母源性污染檢測的孕婦外周血標本分別重新提取DNA，重新進行NIPT和CNV-seq檢測。孕婦NIPT與羊水CNV-seq重測結果均與前一致，排除樣本錯誤因素。

而孕婦外周血CNV-seq檢測結果提示1p35.2-p34.1（30704713-44293117）位置存在約13.59Mb的嵌合重復（非正式外周血CNV-seq報告，所以結果說明中出現"由于CNV嵌合狀態的表型及致病性難以判斷，受檢者的臨床表現尚無法確定"的描述，孕婦本人實際表觀正常。），與NIPT異常結果相符，證實了NIPT異常結果實際是因母源性CNVs導致的假陽性。

孕婦外周血CNV-seq檢測結果1號染色體原始圖譜

后續羊水染色體核型分析結果：常規G顯帶染色體分析未見明顯異常，與CNV-seq結果吻合。

與臨床溝通，告知臨床醫生該孕婦NIPT與CNV-seq結果不一致及原因，正常發放孕婦CNV-seq報告。

案例總結

NIPT檢測技術的誕生，無疑是產前醫學領域的一次創新，它讓無數孕婦避免了不必要的羊水穿刺以及帶來的一系列風險。但作為產前篩查項目它仍具有一定的局限性。

導致NIPT結果假陽性或假陰性的原因主要包括：限制性胎盤嵌合（CPM）、雙胎之一丟失、母體因素（如母親為染色體異常者、母親外周血中胎兒游離DNA濃度低、母親罹患腫瘤）以及技術局限性等。本案例就是因母親拷貝數變異導致的NIPT結果假陽性。

當NIPT出現異常結果時，準媽媽們可能都會緊張害怕，但進一步的遺傳咨詢和產前診斷是非常必要的。如果該孕婦在孕前或孕早期完善外周血染色體核型分析，也會“意外發現”孕婦本人1號染色體p35.2-p34.1區段的大片段重復，可能就會直接選擇羊水穿刺進行產前診斷，也不會有在得知NIPT異常結果時的恐慌，這同時也反映出產前篩查和產前診斷的重要性。

而對于NIPT假陽性問題，我們既希望通過技術創新不斷優化檢測體系，也希望加強對公眾的科普宣傳，以避免過多的“高風險”恐慌。

參考文獻：

[1] Malcher C, Yamamoto G L, Burnham P, et al. Development of a comprehensive noninvasive prenatal test[J]. Genetics and Molecular Biology, 2018, 41(3): 545-554.

[2] 譚玲瓏,黃婷婷,黎俏,等.無創產前檢測技術在胎兒染色體拷貝數變異中的應用[J]. 實用醫學雜志,2021,37(22):2934-2938.

[3] 張彥春,劉凱波,張雯,等. 556例產前無創DNA檢測結果呈假陽的孕產婦受檢指征及部分病例胎盤組織和母血染色體分析[J]. 山東醫藥,2023,63(3):48-50.

醫學界婦產領域交流群正式開放！

加入我們吧！

本文來源：檢驗醫學網

責任編輯：葉子

*'醫學界'力求所發表內容專業、可靠，但不對內容的準確性做出承諾；請相關各方在采用或以此作為決策依據時另行核查。